Ziele und Aufgaben des Arbeitskreis Evolutionsbiologie bestehen darin, die Erkenntnisse der Evolutionswissenschaften über Fachpublikationen, Buchveröffentlichungen, Lehr-Videos und Vortragsreihen in allgemeinverständlicher Form zu verbreiten. Weiterhin beschäftigt sich der AK mit dem Kreationismus in Deutschland.
Der AK vertritt die naturalistische Weltsicht der Giordano Bruno Stiftung (gbs) und des Humanistischen Pressedienstes (hpd). Weiterhin kooperiert der AK mit dem National Center for Science Education (NCSE) in Oakland, CA, USA, und mit der Richard Dawkins Foundation für Vernunft & Wissenschaft.